A região era primitivamente habitada pelos índios Aimorés.

A penetração no território iniciou-se na primeira metade do século XVI, por Francisco Romeo, administrador da Capitania de São Jorge dos Ilhéus que, encantado com a amenidade do clima e a graciosidade do local, iniciou, aí, uma povoação, enfrentando a ira dos aimorés.

Foi tornada vila em 1608, das mais importantes da colônia, inclusive sendo sede de ouvidoria da Capitania de Ilhéus. Município criado por Carta Régia, de 1608, desmembrado de Ilhéus, recebendo a denominação de Vila de Nossa Senhora do Rosário do Cairú. A sede, formada freguesia com o orago de

Nossa Senhora do Rosário, em 1610, foi elevada à categoria de cidade, através Decreto-Lei Estadual de 30.03.1938.

O topônimo é vocábulo tupi que significa casa do sol.

Formação Administrativa

Distrito criado com a denominação de Cairu, em 1610.

Elevado à categoria de vila com a denominação de Cairu, em 1608. Sede na antiga povoação de Cairu.

Em 1616, é criado o Distrito de Velha Boipeba e anexado a vila de Cairu.

Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, a vila aparece constituída de 4 distritos: Cairu, Galeão, Gamboa, Morro de São Paulo e Velha Boipeba.

Assim permanecendo nos quadros de apuração do recenseamento geral de 1-1X-1920.

Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, a vila é constituída de 4 distritos: Cairu, Galeão, Gamboa do Morro (ex-Morro de São Paulo) e Velha Boipeba.

Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.

Elevado à categoria de cidade de com a denominação de Cairu, pelo Decreto-Lei Estadual n] 10724, de 30-03-1938.

Pelo Decreto Estadual nº 11089, de 30-11-1938, o Distrito de Gamboa do Morro tomou a denominação de Gamboa.

Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído de 4 distritos: Cairu, Galeão, Gamboa (ex-Gamboa do Morro) e Velha Boipeba.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2007.